|
|
Studium polymorfizmu DNA mrkve
Sejbalová, Darina
Obsahem této práce je teoretické a praktické studium genetické diverzity mrkve obecné. Cílem byla analýza polymorfismu DNA Daucus carota L. pomocí metod molekulární biologie na bázi izolace DNA, PCR a elektroforetická separace. Celkem bylo analyzováno 20 vzorků mrkve s využitím 10 mikrosatelitních markerů. Bylo detekováno celkem 50 alel s průměrem pěti alel na lokus a velikostí alel mezi 180 a 380 bp. Dále byly vypočítány statistické parametry DI, PI a PIC, které potvrdily vysokou míru polymorfismu použitých SSR markerů. Byl sestaven dendrogram, který poukázal na vztahy mezi jednotlivými odrůdami mrkve. Výsledky byly porovnány s odbornými publikacemi, zabývajícími se stejnou, nebo velmi podobnou problematikou.
|
|
|
Využití molekulárních markerů ve šlechtění mrkve
Sejbalová, Darina
Cílem této práce bylo studium diverzity mrkve obecné (Daucus carota), analýza homogenity rodičovského materiálu, vyhodnocení úspěšnosti křížení, a rozlišení sterilních a fertilních genotypů použitých křížení. Byly analyzovány 4 hybridní odrůdy mrkve a 12 linií, z nichž čtyři byly cytoplasmaticky sterilní (CMS), pomocí deseti SSR markerů a šesti markerů na CMS. Podle vypočítaných statistických hodnot DI, PI a PIC byly použité markery vysoce variabilní. Bylo pomocí nich detekováno celkem 45 alel, s průměrem 4,5 alel na lokus a 4 nulové alely. Velikost alel se pohybovala mezi 180 až 380 bp. Byla vyhodnocena úspěšnost křížení, kdy jako nejúspěšnější bylo vyhodnoceno křížení u odrůdy Koloseum. Čtyři SSR markery byly doporučeny jako vhodné pro další studium diverzity a úspěšnosti křížení u mrkve, a to GSSR-6, GSSR-16, GSSR-91 a GSSR-9. Pomocí markerů pro CMS proběhla úspěšně identifikace sterilních a fertilních linií u jednoho křížení (odrůda Koloseum) s markerem Atp8.
|
|
|
Analýza genetické variability konopí pomocí DNA markerů
Balgová, Barbora
Tato práce se zabývá analýzou genetické variability konopí a sekvenováním kandidátních sekvencí genomu vybraných odrůd konopí. Celkem bylo analyzováno 28 odrůd technického konopí pomocí 23 mikrosatelitních markerů. Bylo nalezeno 107 alel, jejichž velikost byla v rozmezí mezi 100 až 360 bp. Byl detekován jeden uniformní marker (CAN1660). Byly vypočteny hodnoty index diverzity (DI), polymorfní informační obsah (PIC) a index pravděpodobnosti (PI). Byl sestaven dendrogram podobnosti na základě statistického vyhodnocení. Pro studium sekvencí byly použity specifické primery pro částečnou sekvenci genu CBDA syntázy a kompletní sekvenci kódující oblast genu THCA syntázy. Získané sekvence byly porovnány pomocí programu BLAST. Většina sekvencí měla 100% shodu se sekvencemi v dostupných databázích. U sekvencí CBDA syntázy jednotlivých odrůd konopí byly nalezeny jednonukleotidové polymorfismy. Byla detekována jedna sekvence, která nenáležela rodu Cannabis. Všechny získané sekvence budou následně vloženy do databáze NCBI a bude k nim přidělen kód.
|
|
|
Metodika pro diagnostiku přítomnosti brusinky a klikvy ve zpracovaných produktech pomocí molekulárních SSR markerů: metodika pro praxi
Kučera, Ladislav ; Ovesná, Jaroslava
Předmětem metodiky je postup pro diagnostiku přítomnosti brusinky (Vaccinium vitis-idaea L.) a klikvy (Vaccinum macrocarpon L.) ve zpracovaných produktech, například v čajích, nebo v ovocných složkách řady dalších potravinářských výrobků (džemy, rosoly, protlaky). Metodika vychází z faktu, že primární struktura DNA je typická pro každý rostlinný druh. Byly proto využity molekulární DNA markery, které charakterizují daný rostlinný druh délkovou variabilitou mikrosatelitů (SSR- Single Sequence Repeats). Metodika popisuje extrakci DNA z předpokládané matrice, dále sekvence a použití vybraných SSR markerů a postup vyhodnocení analytických dat. Metodu lze použití v běžně vybavené molekulárně-genetické laboratoři. Metoda je použitelná pro charakterizaci DNA izolované z jakékoliv části rostliny, plodů a z nich odvozených potravin či potravních doplňků. Popisuje postup a potřebné vybavení pro provedení analýzy. Doporučuje způsob hodnocení výsledků.
Plný text:  PDF
|
|
|
Studium polymorfizmu DNA mrkve
Sejbalová, Darina
Obsahem této práce je teoretické a praktické studium genetické diverzity mrkve obecné. Cílem byla analýza polymorfismu DNA Daucus carota L. pomocí metod molekulární biologie na bázi izolace DNA, PCR a elektroforetická separace. Celkem bylo analyzováno 20 vzorků mrkve s využitím 10 mikrosatelitních markerů. Bylo detekováno celkem 50 alel s průměrem pěti alel na lokus a velikostí alel mezi 180 a 380 bp. Dále byly vypočítány statistické parametry DI, PI a PIC, které potvrdily vysokou míru polymorfismu použitých SSR markerů. Byl sestaven dendrogram, který poukázal na vztahy mezi jednotlivými odrůdami mrkve. Výsledky byly porovnány s odbornými publikacemi, zabývajícími se stejnou, nebo velmi podobnou problematikou.
|
|
| |
|
| |
|
| |
host ::
RSS.